Ciljevi kolegija Ekološko voćarstvo i vinogradarstvo jesu detaljno upoznavanje studenata sa specifičnostima ekološkog uzgoja voća i vinove loze te razumijevanje utjecaja primjene ekoloških načela proizvodnje na zdravlje čovjeka i očuvanje životne sredine. Također se očekuje da studenti nakon odslušanog kolegija mogu samostalno projektirati nasade ekološkog voća i vinove loze, provoditi ispravnu agro i pomotehniku, njegu i zaštitu ekoloških nasada voća i vinove loze na vlastitim gospodarstvima, ili kao zaposlenici u tvrtkama koje se bave ekološkom proizvodnjom voća.